Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL1Q99990 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms