Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PHF12Q96QT6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms