Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP3Q96P20 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms