Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKNOX2Q96KN3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms