Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZBED3Q96IU2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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