Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LTV1Q96GA3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LTV1Q96GA3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms