Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHFRQ96EP1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms