Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATG4CQ96DT6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG4CQ96DT6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms