Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMIGD2Q96BF3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMIGD2Q96BF3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms