Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP6NLQ92738 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP6NLQ92738 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms