Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RGP1Q92546 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms