Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSPC1Q8WXF1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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