Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
COPS9Q8WXC6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
COPS9Q8WXC6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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