Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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C15orf40Q8WUR7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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C15orf40Q8WUR7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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C15orf40Q8WUR7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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C15orf40Q8WUR7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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C15orf40Q8WUR7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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C15orf40Q8WUR7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C15orf40Q8WUR7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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