Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSKUQ8WUA8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms