Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF17

SH3TC2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2Q8TF17 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3TC2Q8TF17 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms