Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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