Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPC24Q8NBT2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPC24Q8NBT2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms