Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LINC00612Q8N6U2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms