Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NME8Q8N427 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME8Q8N427 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
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