Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMCO2Q7Z6W1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO2Q7Z6W1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms