Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APTXQ7Z2E3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APTXQ7Z2E3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms