Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C12orf54Q6X4T0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C12orf54Q6X4T0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms