Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUX4L9Q6RFH8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUX4L9Q6RFH8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms