Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L2Q6R6M4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms