Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAVIN1Q6NZI2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAVIN1Q6NZI2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms