Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCTP1Q6DN14 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTP1Q6DN14 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms