Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECM29Q5VYK3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms