Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C10orf55Q5SWW7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C10orf55Q5SWW7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms