Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COLEC12Q5KU26 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COLEC12Q5KU26 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms