Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
LACTB2Q53H82 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms