Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM3Q53FZ2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms