Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRY2Q49AN0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRY2Q49AN0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms