Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LETM2Q2VYF4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LETM2Q2VYF4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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