Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIF4BQ2VIQ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4BQ2VIQ3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms