Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC57Q2TAC2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms