Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MICAQ29983 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICAQ29983 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MICAQ29983 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MICAQ29983 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICAQ29983 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICAQ29983 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms