Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTL8BQ17RB0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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