Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NTRK2Q16620 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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