Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC85BQ15834 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC85BQ15834 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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