Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA6Q15825 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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