Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKIV2LQ15477 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKIV2LQ15477 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms