Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CLTC-212ENST00000580081 575 ntTSL 49.58□□□□□ -0.885e-41■■■□□ 18.6
PCBP1Q15365 HYOU1-215ENST00000543287 2464 ntTSL 217.87■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 18.6
PCBP1Q15365 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.615e-7■■■□□ 18.6
PCBP1Q15365 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.515e-7■■■□□ 18.6
PCBP1Q15365 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.125e-7■■■□□ 18.6
PCBP1Q15365 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.112e-6■■■□□ 18.6
PCBP1Q15365 SRRT-214ENST00000614370 556 ntTSL 216.73■□□□□ 0.279e-8■■■□□ 18.6
PCBP1Q15365 SRRT-202ENST00000431645 397 ntTSL 212.4□□□□□ -0.429e-8■■■□□ 18.6
PCBP1Q15365 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.79■□□□□ 0.284e-6■■■□□ 18.5
PCBP1Q15365 FARSA-203ENST00000586146 1707 ntTSL 524.15■■□□□ 1.466e-9■■■□□ 18.5
PCBP1Q15365 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.236e-9■■■□□ 18.5
PCBP1Q15365 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 521.4■■□□□ 1.026e-9■■■□□ 18.5
PCBP1Q15365 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.96e-9■■■□□ 18.5
PCBP1Q15365 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.816e-9■■■□□ 18.5
PCBP1Q15365 FARSA-205ENST00000587488 514 ntTSL 315.37■□□□□ 0.056e-9■■■□□ 18.5
PCBP1Q15365 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.67e-8■■■□□ 18.5
PCBP1Q15365 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.328e-9■■■□□ 18.5
PCBP1Q15365 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.716e-7■■■□□ 18.5
PCBP1Q15365 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.562e-6■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.022e-6■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-6■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 HMGA2-209ENST00000539662 485 ntTSL 311.8□□□□□ -0.522e-6■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 ATP2A2-202ENST00000313432 5575 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.982e-16■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 ATP2A2-212ENST00000553144 264 ntTSL 1 (best)5□□□□□ -1.612e-16■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 SPPL2B-205ENST00000589515 1733 ntTSL 522.34■■□□□ 1.172e-6■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.682e-6■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.062e-6■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.152e-6■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.193e-7■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.23e-7■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.343e-7■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.348e-8■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 BTBD2-207ENST00000589685 2422 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.638e-8■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 BTBD2-210ENST00000592895 2763 ntTSL 218.87■□□□□ 0.618e-8■■■□□ 18.4
PCBP1Q15365 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.292e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.122e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-207ENST00000361140 2701 ntTSL 1 (best)16.87■□□□□ 0.292e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.122e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-202ENST00000311573 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-204ENST00000354691 2498 ntTSL 211.79□□□□□ -0.522e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-216ENST00000442834 2508 ntTSL 211.48□□□□□ -0.572e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.972e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 YY1AP1-215ENST00000436865 2684 ntTSL 1 (best)8.55□□□□□ -1.042e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC7.95□□□□□ -1.142e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CPED1-209ENST00000520801 553 ntTSL 412.68□□□□□ -0.389e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CPED1-204ENST00000428526 2219 ntTSL 28.41□□□□□ -1.069e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.339e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.369e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.49e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CPED1-205ENST00000443817 1118 ntTSL 1 (best)5.31□□□□□ -1.569e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.893e-30■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.693e-30■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.543e-30■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 ABHD14B-207ENST00000487005 1998 ntTSL 218.28■□□□□ 0.523e-30■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.293e-30■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.153e-30■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 PCBP4-213ENST00000489595 539 ntTSL 412.66□□□□□ -0.383e-30■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.081e-26■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 RPLP1-203ENST00000487304 1962 ntTSL 513.14□□□□□ -0.311e-26■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 RPLP1-201ENST00000260379 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.61e-26■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.321e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.15e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.095e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 VTN-203ENST00000542029 501 ntTSL 312.74□□□□□ -0.371e-9■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.685e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.682e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.682e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.912e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.612e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.652e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 ALG3-202ENST00000411922 1452 ntTSL 1 (best)18.9■□□□□ 0.622e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.682e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 SHISA5-212ENST00000465449 1739 ntTSL 219.76■□□□□ 0.752e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 SHISA5-204ENST00000417962 2306 ntTSL 219.68■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.672e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.432e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.362e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.312e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 SHISA5-216ENST00000494854 1908 ntTSL 1 (best)16.43■□□□□ 0.222e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 SHISA5-213ENST00000466424 673 ntTSL 212.81□□□□□ -0.362e-6■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CYBRD1-207ENST00000494587 549 ntTSL 419.74■□□□□ 0.752e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CYBRD1-204ENST00000445146 682 ntTSL 319.61■□□□□ 0.732e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CYBRD1-205ENST00000468308 763 ntTSL 317.59■□□□□ 0.412e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CYBRD1-206ENST00000474182 465 ntTSL 516.78■□□□□ 0.282e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CYBRD1-202ENST00000375252 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.492e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CYBRD1-201ENST00000321348 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.222e-14■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 KHSRP-208ENST00000597656 328 ntTSL 59.23□□□□□ -0.936e-8■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.047e-7■■■□□ 18.3
PCBP1Q15365 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.27e-7■■■□□ 18.3
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