Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMD6Q15008 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMD6Q15008 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms