Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GRIN2CQ14957 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIN2CQ14957 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms