Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNAB1Q14722 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNAB1Q14722 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNAB1Q14722 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNAB1Q14722 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNAB1Q14722 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNAB1Q14722 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNAB1Q14722 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNAB1Q14722 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNAB1Q14722 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNAB1Q14722 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNAB1Q14722 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNAB1Q14722 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNAB1Q14722 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms