Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SEMA3AQ14563 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3AQ14563 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA3AQ14563 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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