Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SQLEQ14534 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SQLEQ14534 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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