Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSHL1Q14406 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CSHL1Q14406 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms