Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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COL9A2Q14055 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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COL9A2Q14055 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COL9A2Q14055 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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